Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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