Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HFEQ30201 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HFEQ30201 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HFEQ30201 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HFEQ30201 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HFEQ30201 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HFEQ30201 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HFEQ30201 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HFEQ30201 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HFEQ30201 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HFEQ30201 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HFEQ30201 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HFEQ30201 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HFEQ30201 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HFEQ30201 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HFEQ30201 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HFEQ30201 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HFEQ30201 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HFEQ30201 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HFEQ30201 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HFEQ30201 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HFEQ30201 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HFEQ30201 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HFEQ30201 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HFEQ30201 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HFEQ30201 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HFEQ30201 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HFEQ30201 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HFEQ30201 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HFEQ30201 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HFEQ30201 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HFEQ30201 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HFEQ30201 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HFEQ30201 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HFEQ30201 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HFEQ30201 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HFEQ30201 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HFEQ30201 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HFEQ30201 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HFEQ30201 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HFEQ30201 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HFEQ30201 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HFEQ30201 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HFEQ30201 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HFEQ30201 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HFEQ30201 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HFEQ30201 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HFEQ30201 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HFEQ30201 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HFEQ30201 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HFEQ30201 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HFEQ30201 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HFEQ30201 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HFEQ30201 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HFEQ30201 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HFEQ30201 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HFEQ30201 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HFEQ30201 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HFEQ30201 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HFEQ30201 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HFEQ30201 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HFEQ30201 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HFEQ30201 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HFEQ30201 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HFEQ30201 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HFEQ30201 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HFEQ30201 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HFEQ30201 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HFEQ30201 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HFEQ30201 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HFEQ30201 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HFEQ30201 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HFEQ30201 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HFEQ30201 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HFEQ30201 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HFEQ30201 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HFEQ30201 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HFEQ30201 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HFEQ30201 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HFEQ30201 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HFEQ30201 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HFEQ30201 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HFEQ30201 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HFEQ30201 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HFEQ30201 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HFEQ30201 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HFEQ30201 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HFEQ30201 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HFEQ30201 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HFEQ30201 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HFEQ30201 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HFEQ30201 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HFEQ30201 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HFEQ30201 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HFEQ30201 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HFEQ30201 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HFEQ30201 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HFEQ30201 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HFEQ30201 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HFEQ30201 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms