Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms