Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms