Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
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