Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZIC1Q15915 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZIC1Q15915 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZIC1Q15915 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZIC1Q15915 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZIC1Q15915 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZIC1Q15915 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZIC1Q15915 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZIC1Q15915 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZIC1Q15915 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ZIC1Q15915 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZIC1Q15915 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZIC1Q15915 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
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