Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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