Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

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Length 389 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms