Protein–RNA interactions for Protein: Q14957

GRIN2C, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2CQ14957 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIN2CQ14957 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIN2CQ14957 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIN2CQ14957 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIN2CQ14957 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIN2CQ14957 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIN2CQ14957 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIN2CQ14957 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIN2CQ14957 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIN2CQ14957 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIN2CQ14957 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIN2CQ14957 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIN2CQ14957 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIN2CQ14957 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIN2CQ14957 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIN2CQ14957 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIN2CQ14957 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIN2CQ14957 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIN2CQ14957 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIN2CQ14957 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIN2CQ14957 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIN2CQ14957 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIN2CQ14957 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIN2CQ14957 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIN2CQ14957 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIN2CQ14957 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIN2CQ14957 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIN2CQ14957 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIN2CQ14957 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIN2CQ14957 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms