Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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