Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms