Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
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