Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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