Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
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