Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
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