Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
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TRAF1Q13077 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
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TRAF1Q13077 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
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TRAF1Q13077 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
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TRAF1Q13077 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
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TRAF1Q13077 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAF1Q13077 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAF1Q13077 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAF1Q13077 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAF1Q13077 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
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TRAF1Q13077 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF1Q13077 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF1Q13077 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF1Q13077 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF1Q13077 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF1Q13077 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF1Q13077 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF1Q13077 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF1Q13077 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF1Q13077 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF1Q13077 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF1Q13077 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF1Q13077 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF1Q13077 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF1Q13077 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF1Q13077 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF1Q13077 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
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