Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms