Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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