Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COX10Q12887 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COX10Q12887 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COX10Q12887 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COX10Q12887 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COX10Q12887 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COX10Q12887 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COX10Q12887 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COX10Q12887 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COX10Q12887 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COX10Q12887 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COX10Q12887 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COX10Q12887 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COX10Q12887 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COX10Q12887 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COX10Q12887 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COX10Q12887 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COX10Q12887 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COX10Q12887 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COX10Q12887 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COX10Q12887 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
COX10Q12887 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COX10Q12887 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COX10Q12887 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COX10Q12887 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COX10Q12887 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COX10Q12887 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COX10Q12887 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COX10Q12887 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COX10Q12887 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COX10Q12887 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COX10Q12887 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COX10Q12887 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COX10Q12887 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COX10Q12887 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COX10Q12887 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COX10Q12887 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COX10Q12887 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
COX10Q12887 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COX10Q12887 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COX10Q12887 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COX10Q12887 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COX10Q12887 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COX10Q12887 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COX10Q12887 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COX10Q12887 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COX10Q12887 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COX10Q12887 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COX10Q12887 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COX10Q12887 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COX10Q12887 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COX10Q12887 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COX10Q12887 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COX10Q12887 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COX10Q12887 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COX10Q12887 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COX10Q12887 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COX10Q12887 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COX10Q12887 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COX10Q12887 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COX10Q12887 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COX10Q12887 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COX10Q12887 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COX10Q12887 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COX10Q12887 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COX10Q12887 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COX10Q12887 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COX10Q12887 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COX10Q12887 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COX10Q12887 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COX10Q12887 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COX10Q12887 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COX10Q12887 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COX10Q12887 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COX10Q12887 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COX10Q12887 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COX10Q12887 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COX10Q12887 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COX10Q12887 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COX10Q12887 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COX10Q12887 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COX10Q12887 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
COX10Q12887 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COX10Q12887 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COX10Q12887 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COX10Q12887 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COX10Q12887 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COX10Q12887 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COX10Q12887 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COX10Q12887 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COX10Q12887 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COX10Q12887 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COX10Q12887 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
COX10Q12887 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COX10Q12887 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
COX10Q12887 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COX10Q12887 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COX10Q12887 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COX10Q12887 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COX10Q12887 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms