Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RAB40BQ12829 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB40BQ12829 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB40BQ12829 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB40BQ12829 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB40BQ12829 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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RAB40BQ12829 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB40BQ12829 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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RAB40BQ12829 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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RAB40BQ12829 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB40BQ12829 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB40BQ12829 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB40BQ12829 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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RAB40BQ12829 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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RAB40BQ12829 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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RAB40BQ12829 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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RAB40BQ12829 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
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RAB40BQ12829 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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