Protein–RNA interactions for Protein: Q12507

SFG1, Superficial pseudohyphal growth protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SFG1Q12507 YJR098CYJR098C 1971 nt1.78□□□□□ -2.12
SFG1Q12507 FIG2YCR089W 4830 nt1.78□□□□□ -2.12
SFG1Q12507 CIC1YHR052W 1131 nt1.78□□□□□ -2.12
SFG1Q12507 HSK3YKL138C-A 210 nt1.78□□□□□ -2.12
SFG1Q12507 IRC19YLL033W 693 nt1.78□□□□□ -2.12
SFG1Q12507 PKR1YMR123W 369 nt1.78□□□□□ -2.12
SFG1Q12507 YMR324CYMR324C 243 nt1.78□□□□□ -2.12
SFG1Q12507 NOP15YNL110C 663 nt1.78□□□□□ -2.12
SFG1Q12507 SPC29YPL124W 762 nt1.78□□□□□ -2.12
SFG1Q12507 GUP1YGL084C 1683 nt1.77□□□□□ -2.13
SFG1Q12507 BTT1YDR252W 450 nt1.77□□□□□ -2.13
SFG1Q12507 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt1.77□□□□□ -2.13
SFG1Q12507 RPC10YHR143W-A 213 nt1.77□□□□□ -2.13
SFG1Q12507 BUD19YJL188C 309 nt1.77□□□□□ -2.13
SFG1Q12507 YJR141WYJR141W 1044 nt1.77□□□□□ -2.13
SFG1Q12507 YKL044WYKL044W 321 nt1.77□□□□□ -2.13
SFG1Q12507 COX7YMR256C 183 nt1.77□□□□□ -2.13
SFG1Q12507 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt1.77□□□□□ -2.13
SFG1Q12507 YBR071WYBR071W 636 nt1.77□□□□□ -2.13
SFG1Q12507 SLM6YBR266C 453 nt1.77□□□□□ -2.13
SFG1Q12507 CFT2YLR115W 2580 nt1.77□□□□□ -2.13
SFG1Q12507 TFC8YPL007C 1767 nt1.77□□□□□ -2.13
SFG1Q12507 MMS22YLR320W 4365 nt1.76□□□□□ -2.13
SFG1Q12507 SEC63YOR254C 1992 nt1.76□□□□□ -2.13
SFG1Q12507 VPS52YDR484W 1926 nt1.76□□□□□ -2.13
SFG1Q12507 YDR210W-AYDR210W-A 1317 nt1.76□□□□□ -2.13
SFG1Q12507 DAD4YDR320C-A 219 nt1.76□□□□□ -2.13
SFG1Q12507 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt1.76□□□□□ -2.13
SFG1Q12507 SIP18YMR175W 240 nt1.76□□□□□ -2.13
SFG1Q12507 MEI5YPL121C 669 nt1.76□□□□□ -2.13
SFG1Q12507 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt1.75□□□□□ -2.13
SFG1Q12507 ZRG8YER033C 3231 nt1.75□□□□□ -2.13
SFG1Q12507 YBR012W-AYBR012W-A 1323 nt1.75□□□□□ -2.13
SFG1Q12507 YOR142W-AYOR142W-A 1323 nt1.75□□□□□ -2.13
SFG1Q12507 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt1.75□□□□□ -2.13
SFG1Q12507 snR79snR79 84 nt1.75□□□□□ -2.13
SFG1Q12507 COX13YGL191W 390 nt1.75□□□□□ -2.13
SFG1Q12507 YNL303WYNL303W 348 nt1.75□□□□□ -2.13
SFG1Q12507 YPL238CYPL238C 390 nt1.75□□□□□ -2.13
SFG1Q12507 YPR153WYPR153W 423 nt1.75□□□□□ -2.13
SFG1Q12507 SNU56YDR240C 1479 nt1.75□□□□□ -2.13
SFG1Q12507 ARP7YPR034W 1434 nt1.74□□□□□ -2.13
SFG1Q12507 SEY1YOR165W 2331 nt1.74□□□□□ -2.13
SFG1Q12507 RTP1YMR185W 2946 nt1.74□□□□□ -2.13
SFG1Q12507 YLR149CYLR149C 2193 nt1.74□□□□□ -2.13
SFG1Q12507 YDL041WYDL041W 354 nt1.74□□□□□ -2.13
SFG1Q12507 PRE4YFR050C 801 nt1.74□□□□□ -2.13
SFG1Q12507 APQ13YJL075C 417 nt1.74□□□□□ -2.13
SFG1Q12507 EAF6YJR082C 342 nt1.74□□□□□ -2.13
SFG1Q12507 MRPL44YMR225C 297 nt1.74□□□□□ -2.13
SFG1Q12507 PGA1YNL158W 597 nt1.74□□□□□ -2.13
SFG1Q12507 RCN2YOR220W 798 nt1.74□□□□□ -2.13
SFG1Q12507 YBR224WYBR224W 516 nt1.74□□□□□ -2.13
SFG1Q12507 VPS34YLR240W 2628 nt1.74□□□□□ -2.13
SFG1Q12507 PEP3YLR148W 2757 nt1.73□□□□□ -2.13
SFG1Q12507 YER188C-AYER188C-A 300 nt1.73□□□□□ -2.13
SFG1Q12507 YBL083CYBL083C 426 nt1.73□□□□□ -2.13
SFG1Q12507 PPN1YDR452W 2025 nt1.73□□□□□ -2.13
SFG1Q12507 YJR079WYJR079W 330 nt1.72□□□□□ -2.13
SFG1Q12507 UTP21YLR409C 2820 nt1.72□□□□□ -2.13
SFG1Q12507 FRK1YPL141C 2598 nt1.72□□□□□ -2.13
SFG1Q12507 YBR184WYBR184W 1572 nt1.72□□□□□ -2.13
SFG1Q12507 YJR039WYJR039W 3366 nt1.72□□□□□ -2.13
SFG1Q12507 PLC1YPL268W 2610 nt1.71□□□□□ -2.13
SFG1Q12507 LYS9YNR050C 1341 nt1.71□□□□□ -2.14
SFG1Q12507 YLR422WYLR422W 5799 nt1.71□□□□□ -2.14
SFG1Q12507 YER068C-AYER068C-A 432 nt1.71□□□□□ -2.14
SFG1Q12507 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt1.71□□□□□ -2.14
SFG1Q12507 IRC16YPR038W 360 nt1.71□□□□□ -2.14
SFG1Q12507 DFG16YOR030W 1860 nt1.71□□□□□ -2.14
SFG1Q12507 RBK1YCR036W 1002 nt1.7□□□□□ -2.14
SFG1Q12507 YGL024WYGL024W 336 nt1.7□□□□□ -2.14
SFG1Q12507 RPL9AYGL147C 576 nt1.7□□□□□ -2.14
SFG1Q12507 STE18YJR086W 333 nt1.7□□□□□ -2.14
SFG1Q12507 VPS15YBR097W 4365 nt1.69□□□□□ -2.14
SFG1Q12507 DAS1YJL149W 1992 nt1.69□□□□□ -2.14
SFG1Q12507 YAP3YHL009C 993 nt1.69□□□□□ -2.14
SFG1Q12507 CMC2YBL059C-A 330 nt1.69□□□□□ -2.14
SFG1Q12507 NOP53YPL146C 1368 nt1.69□□□□□ -2.14
SFG1Q12507 RNH70YGR276C 1662 nt1.68□□□□□ -2.14
SFG1Q12507 PHR1YOR386W 1698 nt1.68□□□□□ -2.14
SFG1Q12507 LHS1YKL073W 2646 nt1.68□□□□□ -2.14
SFG1Q12507 MEC1YBR136W 7107 nt1.68□□□□□ -2.14
SFG1Q12507 YCR043CYCR043C 384 nt1.68□□□□□ -2.14
SFG1Q12507 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt1.68□□□□□ -2.14
SFG1Q12507 YOR392WYOR392W 444 nt1.68□□□□□ -2.14
SFG1Q12507 IRC20YLR247C 4671 nt1.68□□□□□ -2.14
SFG1Q12507 YSW1YBR148W 1830 nt1.68□□□□□ -2.14
SFG1Q12507 YNL144CYNL144C 2223 nt1.67□□□□□ -2.14
SFG1Q12507 CTR9YOL145C 3234 nt1.67□□□□□ -2.14
SFG1Q12507 IRA1YBR140C 9279 nt1.67□□□□□ -2.14
SFG1Q12507 CRG1YHR209W 876 nt1.67□□□□□ -2.14
SFG1Q12507 GPI15YNL038W 690 nt1.67□□□□□ -2.14
SFG1Q12507 BIG1YHR101C 1008 nt1.66□□□□□ -2.14
SFG1Q12507 FMP23YBR047W 528 nt1.66□□□□□ -2.14
SFG1Q12507 PKH3YDR466W 2697 nt1.66□□□□□ -2.14
SFG1Q12507 YGR250CYGR250C 2346 nt1.66□□□□□ -2.14
SFG1Q12507 DOT6YER088C 2013 nt1.66□□□□□ -2.14
SFG1Q12507 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt1.65□□□□□ -2.15
SFG1Q12507 RPL16AYIL133C 600 nt1.65□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.9 ms