Protein–RNA interactions for Protein: Q12502

LDB19, Protein LDB19, yeastyeast

Predictions only

Length 818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LDB19Q12502 tK(CUU)FtK(CUU)F 73 nt4.36□□□□□ -1.71
LDB19Q12502 tK(CUU)G1tK(CUU)G1 73 nt4.36□□□□□ -1.71
LDB19Q12502 tK(CUU)G2tK(CUU)G2 73 nt4.36□□□□□ -1.71
LDB19Q12502 tK(CUU)G3tK(CUU)G3 73 nt4.36□□□□□ -1.71
LDB19Q12502 tK(CUU)ItK(CUU)I 73 nt4.36□□□□□ -1.71
LDB19Q12502 tK(CUU)JtK(CUU)J 73 nt4.36□□□□□ -1.71
LDB19Q12502 tK(CUU)KtK(CUU)K 73 nt4.36□□□□□ -1.71
LDB19Q12502 tK(CUU)MtK(CUU)M 73 nt4.36□□□□□ -1.71
LDB19Q12502 tK(CUU)PtK(CUU)P 73 nt4.36□□□□□ -1.71
LDB19Q12502 OAF3YKR064W 2592 nt4.36□□□□□ -1.71
LDB19Q12502 COG3YER157W 2406 nt4.35□□□□□ -1.71
LDB19Q12502 tQ(UUG)CtQ(UUG)C 72 nt4.35□□□□□ -1.71
LDB19Q12502 tQ(UUG)D1tQ(UUG)D1 72 nt4.35□□□□□ -1.71
LDB19Q12502 tQ(UUG)D2tQ(UUG)D2 72 nt4.35□□□□□ -1.71
LDB19Q12502 tQ(UUG)D3tQ(UUG)D3 72 nt4.35□□□□□ -1.71
LDB19Q12502 tQ(UUG)E1tQ(UUG)E1 72 nt4.35□□□□□ -1.71
LDB19Q12502 tQ(UUG)HtQ(UUG)H 72 nt4.35□□□□□ -1.71
LDB19Q12502 tQ(UUG)LtQ(UUG)L 72 nt4.35□□□□□ -1.71
LDB19Q12502 APL1YJR005W 2103 nt4.35□□□□□ -1.71
LDB19Q12502 NUP85YJR042W 2235 nt4.35□□□□□ -1.71
LDB19Q12502 ATG13YPR185W 2217 nt4.35□□□□□ -1.71
LDB19Q12502 ECM5YMR176W 4236 nt4.35□□□□□ -1.71
LDB19Q12502 YPR003CYPR003C 2265 nt4.34□□□□□ -1.71
LDB19Q12502 YGR237CYGR237C 2358 nt4.34□□□□□ -1.71
LDB19Q12502 RPS8AYBL072C 603 nt4.34□□□□□ -1.71
LDB19Q12502 DOT6YER088C 2013 nt4.34□□□□□ -1.71
LDB19Q12502 LRG1YDL240W 3054 nt4.33□□□□□ -1.72
LDB19Q12502 YDL176WYDL176W 2127 nt4.33□□□□□ -1.72
LDB19Q12502 snR64snR64 101 nt4.33□□□□□ -1.72
LDB19Q12502 RDN5-1RDN5-1 121 nt4.33□□□□□ -1.72
LDB19Q12502 RDN5-6RDN5-6 121 nt4.33□□□□□ -1.72
LDB19Q12502 COS111YBR203W 2775 nt4.33□□□□□ -1.72
LDB19Q12502 SGD1YLR336C 2700 nt4.33□□□□□ -1.72
LDB19Q12502 PDR5YOR153W 4536 nt4.33□□□□□ -1.72
LDB19Q12502 LEU3YLR451W 2661 nt4.32□□□□□ -1.72
LDB19Q12502 SPO75YLL005C 2607 nt4.32□□□□□ -1.72
LDB19Q12502 MNR2YKL064W 2910 nt4.32□□□□□ -1.72
LDB19Q12502 SLM2YNL047C 1971 nt4.32□□□□□ -1.72
LDB19Q12502 CHL1YPL008W 2586 nt4.32□□□□□ -1.72
LDB19Q12502 SKT5YBL061C 2091 nt4.31□□□□□ -1.72
LDB19Q12502 USA1YML029W 2517 nt4.31□□□□□ -1.72
LDB19Q12502 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt4.31□□□□□ -1.72
LDB19Q12502 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt4.31□□□□□ -1.72
LDB19Q12502 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt4.31□□□□□ -1.72
LDB19Q12502 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt4.31□□□□□ -1.72
LDB19Q12502 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt4.31□□□□□ -1.72
LDB19Q12502 YDR261C-DYDR261C-D 4815 nt4.31□□□□□ -1.72
LDB19Q12502 RAD4YER162C 2265 nt4.31□□□□□ -1.72
LDB19Q12502 PUF4YGL014W 2667 nt4.31□□□□□ -1.72
LDB19Q12502 YPR089WYPR089W 2667 nt4.31□□□□□ -1.72
LDB19Q12502 PEP5YMR231W 3090 nt4.3□□□□□ -1.72
LDB19Q12502 SOD1YJR104C 465 nt4.3□□□□□ -1.72
LDB19Q12502 ISW2YOR304W 3363 nt4.3□□□□□ -1.72
LDB19Q12502 SRP14YDL092W 441 nt4.29□□□□□ -1.72
LDB19Q12502 LSO2YGR169C-A 279 nt4.29□□□□□ -1.72
LDB19Q12502 RPL20AYMR242C 519 nt4.29□□□□□ -1.72
LDB19Q12502 UPC2YDR213W 2742 nt4.29□□□□□ -1.72
LDB19Q12502 MPS1YDL028C 2295 nt4.28□□□□□ -1.72
LDB19Q12502 GIP4YAL031C 2283 nt4.28□□□□□ -1.72
LDB19Q12502 AIM44YPL158C 2277 nt4.28□□□□□ -1.72
LDB19Q12502 YML116W-AYML116W-A 303 nt4.28□□□□□ -1.72
LDB19Q12502 ADP1YCR011C 3150 nt4.28□□□□□ -1.72
LDB19Q12502 KHA1YJL094C 2622 nt4.27□□□□□ -1.73
LDB19Q12502 TCB3YML072C 4638 nt4.27□□□□□ -1.73
LDB19Q12502 RPS17BYDR447C 411 nt4.27□□□□□ -1.73
LDB19Q12502 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt4.27□□□□□ -1.73
LDB19Q12502 SEC15YGL233W 2733 nt4.27□□□□□ -1.73
LDB19Q12502 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt4.26□□□□□ -1.73
LDB19Q12502 SGM1YJR134C 2124 nt4.26□□□□□ -1.73
LDB19Q12502 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt4.26□□□□□ -1.73
LDB19Q12502 GLG1YKR058W 1851 nt4.26□□□□□ -1.73
LDB19Q12502 RLI1YDR091C 1827 nt4.25□□□□□ -1.73
LDB19Q12502 YDR193WYDR193W 399 nt4.25□□□□□ -1.73
LDB19Q12502 QCR9YGR183C 201 nt4.25□□□□□ -1.73
LDB19Q12502 snR43snR43 209 nt4.25□□□□□ -1.73
LDB19Q12502 RFX1YLR176C 2436 nt4.25□□□□□ -1.73
LDB19Q12502 YNL018CYNL018C 1839 nt4.25□□□□□ -1.73
LDB19Q12502 UBP1YDL122W 2430 nt4.24□□□□□ -1.73
LDB19Q12502 NAM2YLR382C 2685 nt4.24□□□□□ -1.73
LDB19Q12502 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt4.24□□□□□ -1.73
LDB19Q12502 RPL42BYHR141C 321 nt4.24□□□□□ -1.73
LDB19Q12502 GIS1YDR096W 2685 nt4.24□□□□□ -1.73
LDB19Q12502 FMP16YDR070C 282 nt4.23□□□□□ -1.73
LDB19Q12502 GIN4YDR507C 3429 nt4.23□□□□□ -1.73
LDB19Q12502 SSB1YDL229W 1842 nt4.23□□□□□ -1.73
LDB19Q12502 STE11YLR362W 2154 nt4.23□□□□□ -1.73
LDB19Q12502 RSC3YDR303C 2658 nt4.22□□□□□ -1.73
LDB19Q12502 YBR225WYBR225W 2703 nt4.22□□□□□ -1.73
LDB19Q12502 RRN6YBL014C 2685 nt4.22□□□□□ -1.73
LDB19Q12502 EDS1YBR033W 2760 nt4.21□□□□□ -1.73
LDB19Q12502 YGL182CYGL182C 324 nt4.21□□□□□ -1.74
LDB19Q12502 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt4.21□□□□□ -1.74
LDB19Q12502 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt4.21□□□□□ -1.74
LDB19Q12502 TIF4632YGL049C 2745 nt4.21□□□□□ -1.74
LDB19Q12502 VPH1YOR270C 2523 nt4.21□□□□□ -1.74
LDB19Q12502 NMA111YNL123W 2994 nt4.2□□□□□ -1.74
LDB19Q12502 BRE4YDL231C 3378 nt4.2□□□□□ -1.74
LDB19Q12502 YKL156C-AYKL156C-A 117 nt4.2□□□□□ -1.74
LDB19Q12502 RTC6YPL183W-A 282 nt4.2□□□□□ -1.74
LDB19Q12502 PRP5YBR237W 2550 nt4.2□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 56.9 ms