Protein–RNA interactions for Protein: Q12383

TRM13, tRNA:m(4)X modification enzyme TRM13, yeastyeast

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRM13Q12383 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.74□□□□□ -1.97
TRM13Q12383 RPL38YLR325C 237 nt2.74□□□□□ -1.97
TRM13Q12383 YOR302WYOR302W 78 nt2.74□□□□□ -1.97
TRM13Q12383 HDA3YPR179C 1968 nt2.73□□□□□ -1.97
TRM13Q12383 DYN2YDR424C 279 nt2.73□□□□□ -1.97
TRM13Q12383 OLI1Q0130 231 nt2.73□□□□□ -1.97
TRM13Q12383 ALK2YBL009W 2031 nt2.73□□□□□ -1.97
TRM13Q12383 YER088C-AYER088C-A 324 nt2.72□□□□□ -1.97
TRM13Q12383 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt2.72□□□□□ -1.97
TRM13Q12383 YJL150WYJL150W 303 nt2.72□□□□□ -1.97
TRM13Q12383 YML007C-AYML007C-A 111 nt2.72□□□□□ -1.97
TRM13Q12383 PRP39YML046W 1890 nt2.72□□□□□ -1.97
TRM13Q12383 RPL25YOL127W 429 nt2.72□□□□□ -1.97
TRM13Q12383 UBP14YBR058C 2346 nt2.72□□□□□ -1.97
TRM13Q12383 BPT1YLL015W 4680 nt2.72□□□□□ -1.97
TRM13Q12383 TIM11YDR322C-A 291 nt2.71□□□□□ -1.98
TRM13Q12383 SDH6YDR379C-A 240 nt2.71□□□□□ -1.98
TRM13Q12383 PMR1YGL167C 2853 nt2.71□□□□□ -1.98
TRM13Q12383 YLL032CYLL032C 2478 nt2.7□□□□□ -1.98
TRM13Q12383 MOT1YPL082C 5604 nt2.7□□□□□ -1.98
TRM13Q12383 PUF4YGL014W 2667 nt2.7□□□□□ -1.98
TRM13Q12383 FUN30YAL019W 3396 nt2.7□□□□□ -1.98
TRM13Q12383 IKI3YLR384C 4050 nt2.7□□□□□ -1.98
TRM13Q12383 CSE2YNR010W 450 nt2.7□□□□□ -1.98
TRM13Q12383 YOL057WYOL057W 2136 nt2.7□□□□□ -1.98
TRM13Q12383 SGD1YLR336C 2700 nt2.7□□□□□ -1.98
TRM13Q12383 TOF2YKR010C 2316 nt2.69□□□□□ -1.98
TRM13Q12383 NAB3YPL190C 2409 nt2.69□□□□□ -1.98
TRM13Q12383 VAS1YGR094W 3315 nt2.69□□□□□ -1.98
TRM13Q12383 YDR426CYDR426C 378 nt2.69□□□□□ -1.98
TRM13Q12383 ASG1YIL130W 2895 nt2.69□□□□□ -1.98
TRM13Q12383 TSC11YER093C 4293 nt2.69□□□□□ -1.98
TRM13Q12383 TAO3YIL129C 7131 nt2.69□□□□□ -1.98
TRM13Q12383 ORC1YML065W 2745 nt2.69□□□□□ -1.98
TRM13Q12383 NCL1YBL024W 2055 nt2.69□□□□□ -1.98
TRM13Q12383 TOM1YDR457W 9807 nt2.68□□□□□ -1.98
TRM13Q12383 NET1YJL076W 3570 nt2.68□□□□□ -1.98
TRM13Q12383 snR85snR85 171 nt2.68□□□□□ -1.98
TRM13Q12383 YLR140WYLR140W 327 nt2.68□□□□□ -1.98
TRM13Q12383 VMA9YCL005W-A 222 nt2.68□□□□□ -1.98
TRM13Q12383 ATG26YLR189C 3597 nt2.68□□□□□ -1.98
TRM13Q12383 YAT2YER024W 2772 nt2.67□□□□□ -1.98
TRM13Q12383 PSK1YAL017W 4071 nt2.67□□□□□ -1.98
TRM13Q12383 LCD1YDR499W 2244 nt2.67□□□□□ -1.98
TRM13Q12383 ATG13YPR185W 2217 nt2.67□□□□□ -1.98
TRM13Q12383 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt2.67□□□□□ -1.98
TRM13Q12383 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt2.67□□□□□ -1.98
TRM13Q12383 FRE2YKL220C 2136 nt2.67□□□□□ -1.98
TRM13Q12383 RRT15YLR162W-A 189 nt2.67□□□□□ -1.98
TRM13Q12383 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt2.67□□□□□ -1.98
TRM13Q12383 COS111YBR203W 2775 nt2.67□□□□□ -1.98
TRM13Q12383 RLI1YDR091C 1827 nt2.67□□□□□ -1.98
TRM13Q12383 INP52YNL106C 3552 nt2.66□□□□□ -1.98
TRM13Q12383 PSY2YNL201C 2577 nt2.66□□□□□ -1.98
TRM13Q12383 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt2.66□□□□□ -1.98
TRM13Q12383 snR76snR76 109 nt2.66□□□□□ -1.98
TRM13Q12383 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt2.66□□□□□ -1.98
TRM13Q12383 YMR321CYMR321C 318 nt2.66□□□□□ -1.98
TRM13Q12383 FPR1YNL135C 345 nt2.66□□□□□ -1.98
TRM13Q12383 MDM1YML104C 3384 nt2.66□□□□□ -1.98
TRM13Q12383 NPR3YHL023C 3441 nt2.66□□□□□ -1.98
TRM13Q12383 TFC4YGR047C 3078 nt2.66□□□□□ -1.98
TRM13Q12383 RSN1YMR266W 2862 nt2.66□□□□□ -1.98
TRM13Q12383 DSE4YNR067C 3354 nt2.65□□□□□ -1.98
TRM13Q12383 YLR278CYLR278C 4026 nt2.65□□□□□ -1.98
TRM13Q12383 YGL069CYGL069C 465 nt2.65□□□□□ -1.99
TRM13Q12383 TRX1YLR043C 312 nt2.65□□□□□ -1.99
TRM13Q12383 RTC6YPL183W-A 282 nt2.65□□□□□ -1.99
TRM13Q12383 SLH1YGR271W 5904 nt2.65□□□□□ -1.99
TRM13Q12383 IPT1YDR072C 1584 nt2.65□□□□□ -1.99
TRM13Q12383 RAX2YLR084C 3663 nt2.65□□□□□ -1.99
TRM13Q12383 KSP1YHR082C 3090 nt2.65□□□□□ -1.99
TRM13Q12383 PAN3YKL025C 2040 nt2.64□□□□□ -1.99
TRM13Q12383 GUP1YGL084C 1683 nt2.64□□□□□ -1.99
TRM13Q12383 VPH1YOR270C 2523 nt2.64□□□□□ -1.99
TRM13Q12383 ECM29YHL030W 5607 nt2.64□□□□□ -1.99
TRM13Q12383 YJL135WYJL135W 318 nt2.64□□□□□ -1.99
TRM13Q12383 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt2.64□□□□□ -1.99
TRM13Q12383 YBR224WYBR224W 516 nt2.64□□□□□ -1.99
TRM13Q12383 PEX8YGR077C 1770 nt2.64□□□□□ -1.99
TRM13Q12383 DBP7YKR024C 2229 nt2.64□□□□□ -1.99
TRM13Q12383 AKR1YDR264C 2295 nt2.63□□□□□ -1.99
TRM13Q12383 EFR3YMR212C 2349 nt2.63□□□□□ -1.99
TRM13Q12383 PTC5YOR090C 1719 nt2.63□□□□□ -1.99
TRM13Q12383 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt2.63□□□□□ -1.99
TRM13Q12383 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt2.63□□□□□ -1.99
TRM13Q12383 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt2.63□□□□□ -1.99
TRM13Q12383 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt2.63□□□□□ -1.99
TRM13Q12383 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt2.63□□□□□ -1.99
TRM13Q12383 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt2.63□□□□□ -1.99
TRM13Q12383 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt2.63□□□□□ -1.99
TRM13Q12383 FMP32YFL046W 624 nt2.63□□□□□ -1.99
TRM13Q12383 YPR203WYPR203W 309 nt2.63□□□□□ -1.99
TRM13Q12383 YKU70YMR284W 1809 nt2.63□□□□□ -1.99
TRM13Q12383 NMD2YHR077C 3270 nt2.62□□□□□ -1.99
TRM13Q12383 YHL005CYHL005C 393 nt2.62□□□□□ -1.99
TRM13Q12383 PDE2YOR360C 1581 nt2.61□□□□□ -1.99
TRM13Q12383 CFT2YLR115W 2580 nt2.61□□□□□ -1.99
TRM13Q12383 TAF2YCR042C 4224 nt2.61□□□□□ -1.99
TRM13Q12383 RGR1YLR071C 3249 nt2.61□□□□□ -1.99
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