Protein–RNA interactions for Protein: Q12173

TY3A-G, Transposon Ty3-G Gag polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY3A-GQ12173 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt1.63□□□□□ -2.15
TY3A-GQ12173 ATP15YPL271W 189 nt1.63□□□□□ -2.15
TY3A-GQ12173 RIC1YLR039C 3171 nt1.62□□□□□ -2.15
TY3A-GQ12173 PAU2YEL049W 363 nt1.62□□□□□ -2.15
TY3A-GQ12173 SMD1YGR074W 441 nt1.62□□□□□ -2.15
TY3A-GQ12173 VMA21YGR105W 234 nt1.62□□□□□ -2.15
TY3A-GQ12173 PAU12YGR294W 363 nt1.62□□□□□ -2.15
TY3A-GQ12173 PAU18YLL064C 363 nt1.62□□□□□ -2.15
TY3A-GQ12173 GMC2YLR445W 567 nt1.62□□□□□ -2.15
TY3A-GQ12173 UBX4YMR067C 1251 nt1.62□□□□□ -2.15
TY3A-GQ12173 PAU6YNR076W 363 nt1.62□□□□□ -2.15
TY3A-GQ12173 PAU24YBR301W 363 nt1.62□□□□□ -2.15
TY3A-GQ12173 BFA1YJR053W 1725 nt1.62□□□□□ -2.15
TY3A-GQ12173 AFR1YDR085C 1863 nt1.61□□□□□ -2.15
TY3A-GQ12173 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt1.61□□□□□ -2.15
TY3A-GQ12173 YER121WYER121W 345 nt1.61□□□□□ -2.15
TY3A-GQ12173 DFG10YIL049W 762 nt1.61□□□□□ -2.15
TY3A-GQ12173 RPL40AYIL148W 387 nt1.61□□□□□ -2.15
TY3A-GQ12173 PEP8YJL053W 1140 nt1.61□□□□□ -2.15
TY3A-GQ12173 CHC1YGL206C 4962 nt1.61□□□□□ -2.15
TY3A-GQ12173 YER038W-AYER038W-A 381 nt1.6□□□□□ -2.15
TY3A-GQ12173 PRM8YGL053W 714 nt1.6□□□□□ -2.15
TY3A-GQ12173 Q0144Q0144 330 nt1.6□□□□□ -2.15
TY3A-GQ12173 RPI1YIL119C 1224 nt1.6□□□□□ -2.15
TY3A-GQ12173 STE18YJR086W 333 nt1.6□□□□□ -2.15
TY3A-GQ12173 YJR141WYJR141W 1044 nt1.6□□□□□ -2.15
TY3A-GQ12173 YNL010WYNL010W 726 nt1.6□□□□□ -2.15
TY3A-GQ12173 YOR364WYOR364W 369 nt1.6□□□□□ -2.15
TY3A-GQ12173 YPR096CYPR096C 303 nt1.6□□□□□ -2.15
TY3A-GQ12173 SPO22YIL073C 2928 nt1.6□□□□□ -2.15
TY3A-GQ12173 FRK1YPL141C 2598 nt1.6□□□□□ -2.15
TY3A-GQ12173 YLR419WYLR419W 4308 nt1.6□□□□□ -2.15
TY3A-GQ12173 BRO1YPL084W 2535 nt1.6□□□□□ -2.15
TY3A-GQ12173 TTI1YKL033W 3117 nt1.6□□□□□ -2.15
TY3A-GQ12173 COX1Q0045 1605 nt1.59□□□□□ -2.15
TY3A-GQ12173 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt1.59□□□□□ -2.15
TY3A-GQ12173 YOR029WYOR029W 336 nt1.59□□□□□ -2.15
TY3A-GQ12173 RRI2YOL117W 1938 nt1.59□□□□□ -2.15
TY3A-GQ12173 IRA1YBR140C 9279 nt1.59□□□□□ -2.16
TY3A-GQ12173 VPS15YBR097W 4365 nt1.59□□□□□ -2.16
TY3A-GQ12173 EMC4YGL231C 573 nt1.58□□□□□ -2.16
TY3A-GQ12173 RNR4YGR180C 1038 nt1.58□□□□□ -2.16
TY3A-GQ12173 TRX1YLR043C 312 nt1.58□□□□□ -2.16
TY3A-GQ12173 PHR1YOR386W 1698 nt1.58□□□□□ -2.16
TY3A-GQ12173 SPE1YKL184W 1401 nt1.57□□□□□ -2.16
TY3A-GQ12173 SNU56YDR240C 1479 nt1.57□□□□□ -2.16
TY3A-GQ12173 SLM1YIL105C 2061 nt1.57□□□□□ -2.16
TY3A-GQ12173 TBS1YBR150C 3285 nt1.57□□□□□ -2.16
TY3A-GQ12173 RPL31AYDL075W 342 nt1.57□□□□□ -2.16
TY3A-GQ12173 MZM1YDR493W 372 nt1.57□□□□□ -2.16
TY3A-GQ12173 RAD6YGL058W 519 nt1.57□□□□□ -2.16
TY3A-GQ12173 GRX8YLR364W 330 nt1.57□□□□□ -2.16
TY3A-GQ12173 ZRG8YER033C 3231 nt1.57□□□□□ -2.16
TY3A-GQ12173 YAR009CYAR009C 3591 nt1.56□□□□□ -2.16
TY3A-GQ12173 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.56□□□□□ -2.16
TY3A-GQ12173 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.56□□□□□ -2.16
TY3A-GQ12173 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.56□□□□□ -2.16
TY3A-GQ12173 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.56□□□□□ -2.16
TY3A-GQ12173 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.56□□□□□ -2.16
TY3A-GQ12173 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.56□□□□□ -2.16
TY3A-GQ12173 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.56□□□□□ -2.16
TY3A-GQ12173 GIC1YHR061C 945 nt1.56□□□□□ -2.16
TY3A-GQ12173 ARV1YLR242C 966 nt1.56□□□□□ -2.16
TY3A-GQ12173 PKR1YMR123W 369 nt1.56□□□□□ -2.16
TY3A-GQ12173 RPS7BYNL096C 573 nt1.56□□□□□ -2.16
TY3A-GQ12173 PLC1YPL268W 2610 nt1.56□□□□□ -2.16
TY3A-GQ12173 RKM1YPL208W 1752 nt1.55□□□□□ -2.16
TY3A-GQ12173 YSW1YBR148W 1830 nt1.55□□□□□ -2.16
TY3A-GQ12173 YER175W-AYER175W-A 165 nt1.55□□□□□ -2.16
TY3A-GQ12173 RPL29YFR032C-A 180 nt1.55□□□□□ -2.16
TY3A-GQ12173 YIL029CYIL029C 429 nt1.55□□□□□ -2.16
TY3A-GQ12173 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt1.55□□□□□ -2.16
TY3A-GQ12173 TPM2YIL138C 486 nt1.55□□□□□ -2.16
TY3A-GQ12173 YJL127C-BYJL127C-B 159 nt1.55□□□□□ -2.16
TY3A-GQ12173 YLR252WYLR252W 306 nt1.55□□□□□ -2.16
TY3A-GQ12173 IRE1YHR079C 3348 nt1.55□□□□□ -2.16
TY3A-GQ12173 YBP1YBR216C 2025 nt1.54□□□□□ -2.16
TY3A-GQ12173 CDC27YBL084C 2277 nt1.54□□□□□ -2.16
TY3A-GQ12173 snR84snR84 550 nt1.54□□□□□ -2.16
TY3A-GQ12173 YGL069CYGL069C 465 nt1.54□□□□□ -2.16
TY3A-GQ12173 LRP1YHR081W 555 nt1.54□□□□□ -2.16
TY3A-GQ12173 ILM1YJR118C 612 nt1.54□□□□□ -2.16
TY3A-GQ12173 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt1.54□□□□□ -2.16
TY3A-GQ12173 PGA1YNL158W 597 nt1.54□□□□□ -2.16
TY3A-GQ12173 LOA1YPR139C 903 nt1.54□□□□□ -2.16
TY3A-GQ12173 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.54□□□□□ -2.16
TY3A-GQ12173 SPC98YNL126W 2541 nt1.54□□□□□ -2.16
TY3A-GQ12173 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt1.53□□□□□ -2.16
TY3A-GQ12173 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt1.53□□□□□ -2.16
TY3A-GQ12173 YDR220CYDR220C 294 nt1.53□□□□□ -2.16
TY3A-GQ12173 CHZ1YER030W 462 nt1.53□□□□□ -2.16
TY3A-GQ12173 LAG1YHL003C 1236 nt1.53□□□□□ -2.16
TY3A-GQ12173 YKL044WYKL044W 321 nt1.53□□□□□ -2.16
TY3A-GQ12173 CTK3YML112W 891 nt1.53□□□□□ -2.16
TY3A-GQ12173 YOR343W-AYOR343W-A 1317 nt1.53□□□□□ -2.16
TY3A-GQ12173 KCS1YDR017C 3153 nt1.53□□□□□ -2.17
TY3A-GQ12173 NUP145YGL092W 3954 nt1.52□□□□□ -2.17
TY3A-GQ12173 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt1.52□□□□□ -2.17
TY3A-GQ12173 YGL015CYGL015C 393 nt1.52□□□□□ -2.17
TY3A-GQ12173 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.52□□□□□ -2.17
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