Protein–RNA interactions for Protein: Q12004

TFB4, General transcription and DNA repair factor IIH subunit TFB4, yeastyeast

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TFB4Q12004 RDN5-6RDN5-6 121 nt3.99□□□□□ -1.77
TFB4Q12004 YOR073W-AYOR073W-A 234 nt3.99□□□□□ -1.77
TFB4Q12004 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt3.99□□□□□ -1.77
TFB4Q12004 SGD1YLR336C 2700 nt3.99□□□□□ -1.77
TFB4Q12004 COS111YBR203W 2775 nt3.98□□□□□ -1.77
TFB4Q12004 SUP56tL(CAA)A 82 nt3.98□□□□□ -1.77
TFB4Q12004 SUP53tL(CAA)C 82 nt3.98□□□□□ -1.77
TFB4Q12004 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt3.98□□□□□ -1.77
TFB4Q12004 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt3.98□□□□□ -1.77
TFB4Q12004 SUP54tL(CAA)G2 82 nt3.98□□□□□ -1.77
TFB4Q12004 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt3.98□□□□□ -1.77
TFB4Q12004 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt3.98□□□□□ -1.77
TFB4Q12004 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt3.98□□□□□ -1.77
TFB4Q12004 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt3.98□□□□□ -1.77
TFB4Q12004 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt3.98□□□□□ -1.77
TFB4Q12004 YML116W-AYML116W-A 303 nt3.98□□□□□ -1.77
TFB4Q12004 VMA9YCL005W-A 222 nt3.98□□□□□ -1.77
TFB4Q12004 MCM7YBR202W 2538 nt3.97□□□□□ -1.77
TFB4Q12004 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt3.97□□□□□ -1.77
TFB4Q12004 XRS2YDR369C 2565 nt3.97□□□□□ -1.77
TFB4Q12004 FAS1YKL182W 6156 nt3.96□□□□□ -1.77
TFB4Q12004 EXO84YBR102C 2262 nt3.96□□□□□ -1.78
TFB4Q12004 FLO10YKR102W 3510 nt3.96□□□□□ -1.78
TFB4Q12004 RPG1YBR079C 2895 nt3.96□□□□□ -1.78
TFB4Q12004 EMC6YLL014W 327 nt3.96□□□□□ -1.78
TFB4Q12004 PRP22YER013W 3438 nt3.96□□□□□ -1.78
TFB4Q12004 TCB3YML072C 4638 nt3.95□□□□□ -1.78
TFB4Q12004 tQ(UUG)CtQ(UUG)C 72 nt3.95□□□□□ -1.78
TFB4Q12004 tQ(UUG)D1tQ(UUG)D1 72 nt3.95□□□□□ -1.78
TFB4Q12004 tQ(UUG)D2tQ(UUG)D2 72 nt3.95□□□□□ -1.78
TFB4Q12004 tQ(UUG)D3tQ(UUG)D3 72 nt3.95□□□□□ -1.78
TFB4Q12004 tQ(UUG)E1tQ(UUG)E1 72 nt3.95□□□□□ -1.78
TFB4Q12004 tQ(UUG)HtQ(UUG)H 72 nt3.95□□□□□ -1.78
TFB4Q12004 tQ(UUG)LtQ(UUG)L 72 nt3.95□□□□□ -1.78
TFB4Q12004 SEC15YGL233W 2733 nt3.95□□□□□ -1.78
TFB4Q12004 VPH1YOR270C 2523 nt3.95□□□□□ -1.78
TFB4Q12004 USA1YML029W 2517 nt3.94□□□□□ -1.78
TFB4Q12004 EMP24YGL200C 612 nt3.94□□□□□ -1.78
TFB4Q12004 YLR282CYLR282C 342 nt3.94□□□□□ -1.78
TFB4Q12004 VBA4YDR119W 2307 nt3.94□□□□□ -1.78
TFB4Q12004 GIS4YML006C 2325 nt3.93□□□□□ -1.78
TFB4Q12004 VPS53YJL029C 2469 nt3.93□□□□□ -1.78
TFB4Q12004 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt3.93□□□□□ -1.78
TFB4Q12004 YJR112W-AYJR112W-A 330 nt3.93□□□□□ -1.78
TFB4Q12004 MTC4YBR255W 2085 nt3.93□□□□□ -1.78
TFB4Q12004 ERB1YMR049C 2424 nt3.92□□□□□ -1.78
TFB4Q12004 MET10YFR030W 3108 nt3.92□□□□□ -1.78
TFB4Q12004 JEN1YKL217W 1851 nt3.92□□□□□ -1.78
TFB4Q12004 FAR1YJL157C 2493 nt3.92□□□□□ -1.78
TFB4Q12004 ELG1YOR144C 2376 nt3.91□□□□□ -1.78
TFB4Q12004 TMA108YIL137C 2841 nt3.91□□□□□ -1.78
TFB4Q12004 HEF3YNL014W 3135 nt3.91□□□□□ -1.78
TFB4Q12004 SAK1YER129W 3429 nt3.91□□□□□ -1.78
TFB4Q12004 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt3.91□□□□□ -1.78
TFB4Q12004 KAP95YLR347C 2586 nt3.91□□□□□ -1.78
TFB4Q12004 PHM6YDR281C 315 nt3.91□□□□□ -1.78
TFB4Q12004 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt3.91□□□□□ -1.78
TFB4Q12004 GRX8YLR364W 330 nt3.91□□□□□ -1.78
TFB4Q12004 YBR277CYBR277C 402 nt3.91□□□□□ -1.78
TFB4Q12004 MPH1YIR002C 2982 nt3.91□□□□□ -1.78
TFB4Q12004 ZRG17YNR039C 1818 nt3.91□□□□□ -1.78
TFB4Q12004 NTO1YPR031W 2247 nt3.9□□□□□ -1.78
TFB4Q12004 SOK1YDR006C 2706 nt3.9□□□□□ -1.78
TFB4Q12004 PAA1YDR071C 576 nt3.9□□□□□ -1.79
TFB4Q12004 TIM11YDR322C-A 291 nt3.9□□□□□ -1.79
TFB4Q12004 YGR050CYGR050C 357 nt3.9□□□□□ -1.79
TFB4Q12004 VPS34YLR240W 2628 nt3.9□□□□□ -1.79
TFB4Q12004 RSN1YMR266W 2862 nt3.89□□□□□ -1.79
TFB4Q12004 RPL14AYKL006W 417 nt3.89□□□□□ -1.79
TFB4Q12004 YKL162C-AYKL162C-A 153 nt3.89□□□□□ -1.79
TFB4Q12004 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt3.89□□□□□ -1.79
TFB4Q12004 YNL211CYNL211C 261 nt3.89□□□□□ -1.79
TFB4Q12004 HAL9YOL089C 3093 nt3.89□□□□□ -1.79
TFB4Q12004 RPN2YIL075C 2838 nt3.88□□□□□ -1.79
TFB4Q12004 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt3.88□□□□□ -1.79
TFB4Q12004 YBR174CYBR174C 315 nt3.88□□□□□ -1.79
TFB4Q12004 NAB3YPL190C 2409 nt3.87□□□□□ -1.79
TFB4Q12004 YLR149CYLR149C 2193 nt3.87□□□□□ -1.79
TFB4Q12004 ZDS2YML109W 2829 nt3.87□□□□□ -1.79
TFB4Q12004 PFF1YBR074W 2931 nt3.87□□□□□ -1.79
TFB4Q12004 HYP2YEL034W 474 nt3.87□□□□□ -1.79
TFB4Q12004 MYO3YKL129C 3819 nt3.87□□□□□ -1.79
TFB4Q12004 COP1YDL145C 3606 nt3.87□□□□□ -1.79
TFB4Q12004 PXA2YKL188C 2562 nt3.87□□□□□ -1.79
TFB4Q12004 SYT1YPR095C 3681 nt3.86□□□□□ -1.79
TFB4Q12004 RPO31YOR116C 4383 nt3.86□□□□□ -1.79
TFB4Q12004 SPO75YLL005C 2607 nt3.86□□□□□ -1.79
TFB4Q12004 IES6YEL044W 501 nt3.86□□□□□ -1.79
TFB4Q12004 YGR051CYGR051C 324 nt3.86□□□□□ -1.79
TFB4Q12004 VPS35YJL154C 2835 nt3.86□□□□□ -1.79
TFB4Q12004 PSK2YOL045W 3306 nt3.86□□□□□ -1.79
TFB4Q12004 ITC1YGL133W 3795 nt3.86□□□□□ -1.79
TFB4Q12004 NCA2YPR155C 1851 nt3.86□□□□□ -1.79
TFB4Q12004 YDL196WYDL196W 330 nt3.85□□□□□ -1.79
TFB4Q12004 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt3.85□□□□□ -1.79
TFB4Q12004 GRR1YJR090C 3456 nt3.85□□□□□ -1.79
TFB4Q12004 YIL174WYIL174W 228 nt3.84□□□□□ -1.79
TFB4Q12004 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt3.84□□□□□ -1.79
TFB4Q12004 SQS1YNL224C 2304 nt3.84□□□□□ -1.79
TFB4Q12004 NPR3YHL023C 3441 nt3.84□□□□□ -1.8
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