Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms