Protein–RNA interactions for Protein: Q08043

ACTN3, Alpha-actinin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3Q08043 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms