Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC18A2Q05940 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC18A2Q05940 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC18A2Q05940 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC18A2Q05940 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC18A2Q05940 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC18A2Q05940 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC18A2Q05940 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC18A2Q05940 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC18A2Q05940 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC18A2Q05940 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC18A2Q05940 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC18A2Q05940 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC18A2Q05940 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC18A2Q05940 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC18A2Q05940 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC18A2Q05940 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC18A2Q05940 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC18A2Q05940 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC18A2Q05940 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC18A2Q05940 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC18A2Q05940 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC18A2Q05940 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC18A2Q05940 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC18A2Q05940 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC18A2Q05940 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC18A2Q05940 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC18A2Q05940 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC18A2Q05940 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC18A2Q05940 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC18A2Q05940 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLC18A2Q05940 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms