Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms