Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
ATP7AQ04656 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ATP7AQ04656 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
ATP7AQ04656 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ATP7AQ04656 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ATP7AQ04656 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ATP7AQ04656 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ATP7AQ04656 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ATP7AQ04656 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ATP7AQ04656 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ATP7AQ04656 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ATP7AQ04656 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ATP7AQ04656 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ATP7AQ04656 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
ATP7AQ04656 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ATP7AQ04656 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ATP7AQ04656 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ATP7AQ04656 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ATP7AQ04656 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ATP7AQ04656 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ATP7AQ04656 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
ATP7AQ04656 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ATP7AQ04656 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ATP7AQ04656 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ATP7AQ04656 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ATP7AQ04656 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ATP7AQ04656 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ATP7AQ04656 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ATP7AQ04656 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ATP7AQ04656 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ATP7AQ04656 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ATP7AQ04656 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ATP7AQ04656 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ATP7AQ04656 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ATP7AQ04656 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ATP7AQ04656 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ATP7AQ04656 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
ATP7AQ04656 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ATP7AQ04656 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
ATP7AQ04656 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ATP7AQ04656 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
ATP7AQ04656 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
ATP7AQ04656 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
ATP7AQ04656 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
ATP7AQ04656 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
ATP7AQ04656 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ATP7AQ04656 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ATP7AQ04656 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
ATP7AQ04656 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
ATP7AQ04656 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
ATP7AQ04656 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ATP7AQ04656 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ATP7AQ04656 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ATP7AQ04656 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
ATP7AQ04656 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ATP7AQ04656 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ATP7AQ04656 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ATP7AQ04656 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ATP7AQ04656 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ATP7AQ04656 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ATP7AQ04656 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ATP7AQ04656 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ATP7AQ04656 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ATP7AQ04656 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
ATP7AQ04656 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ATP7AQ04656 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ATP7AQ04656 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
ATP7AQ04656 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ATP7AQ04656 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
ATP7AQ04656 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ATP7AQ04656 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ATP7AQ04656 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
ATP7AQ04656 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ATP7AQ04656 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ATP7AQ04656 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ATP7AQ04656 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ATP7AQ04656 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
ATP7AQ04656 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ATP7AQ04656 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ATP7AQ04656 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
ATP7AQ04656 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ATP7AQ04656 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
ATP7AQ04656 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
ATP7AQ04656 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
ATP7AQ04656 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
ATP7AQ04656 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ATP7AQ04656 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ATP7AQ04656 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ATP7AQ04656 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
ATP7AQ04656 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ATP7AQ04656 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ATP7AQ04656 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ATP7AQ04656 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ATP7AQ04656 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ATP7AQ04656 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
ATP7AQ04656 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ATP7AQ04656 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ATP7AQ04656 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ATP7AQ04656 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
ATP7AQ04656 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms