Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms