Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
TOP2BQ02880 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC34.23■■■■□ 3.07
TOP2BQ02880 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
TOP2BQ02880 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
TOP2BQ02880 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
TOP2BQ02880 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
TOP2BQ02880 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
TOP2BQ02880 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
TOP2BQ02880 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
TOP2BQ02880 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
TOP2BQ02880 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
TOP2BQ02880 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
TOP2BQ02880 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
TOP2BQ02880 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
TOP2BQ02880 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
TOP2BQ02880 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
TOP2BQ02880 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
TOP2BQ02880 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
TOP2BQ02880 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
TOP2BQ02880 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
TOP2BQ02880 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
TOP2BQ02880 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
TOP2BQ02880 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
TOP2BQ02880 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
TOP2BQ02880 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
TOP2BQ02880 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
TOP2BQ02880 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
TOP2BQ02880 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
TOP2BQ02880 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
TOP2BQ02880 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
TOP2BQ02880 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
TOP2BQ02880 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
TOP2BQ02880 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
TOP2BQ02880 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
TOP2BQ02880 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
TOP2BQ02880 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
TOP2BQ02880 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
TOP2BQ02880 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
TOP2BQ02880 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
TOP2BQ02880 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
TOP2BQ02880 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
TOP2BQ02880 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
TOP2BQ02880 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
TOP2BQ02880 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
TOP2BQ02880 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
TOP2BQ02880 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
TOP2BQ02880 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
TOP2BQ02880 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
TOP2BQ02880 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
TOP2BQ02880 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
TOP2BQ02880 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
TOP2BQ02880 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
TOP2BQ02880 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
TOP2BQ02880 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
TOP2BQ02880 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
TOP2BQ02880 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC34.19■■■■□ 3.06
TOP2BQ02880 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
TOP2BQ02880 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
TOP2BQ02880 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
TOP2BQ02880 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
TOP2BQ02880 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
TOP2BQ02880 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
TOP2BQ02880 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
TOP2BQ02880 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
TOP2BQ02880 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
TOP2BQ02880 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
TOP2BQ02880 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
TOP2BQ02880 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
TOP2BQ02880 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
TOP2BQ02880 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
TOP2BQ02880 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
TOP2BQ02880 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
TOP2BQ02880 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
TOP2BQ02880 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
TOP2BQ02880 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
TOP2BQ02880 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
TOP2BQ02880 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
TOP2BQ02880 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
TOP2BQ02880 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
TOP2BQ02880 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
TOP2BQ02880 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
TOP2BQ02880 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TOP2BQ02880 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TOP2BQ02880 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TOP2BQ02880 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TOP2BQ02880 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TOP2BQ02880 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
TOP2BQ02880 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TOP2BQ02880 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TOP2BQ02880 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
TOP2BQ02880 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
TOP2BQ02880 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
TOP2BQ02880 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
TOP2BQ02880 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TOP2BQ02880 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TOP2BQ02880 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TOP2BQ02880 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TOP2BQ02880 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
TOP2BQ02880 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
TOP2BQ02880 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms