Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms