Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms