Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms