Protein–RNA interactions for Protein: P98161

PKD1, Polycystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 4,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1P98161 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PKD1P98161 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PKD1P98161 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PKD1P98161 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PKD1P98161 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PKD1P98161 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PKD1P98161 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PKD1P98161 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PKD1P98161 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PKD1P98161 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PKD1P98161 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PKD1P98161 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PKD1P98161 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PKD1P98161 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PKD1P98161 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PKD1P98161 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PKD1P98161 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PKD1P98161 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PKD1P98161 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PKD1P98161 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PKD1P98161 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PKD1P98161 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PKD1P98161 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PKD1P98161 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PKD1P98161 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PKD1P98161 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PKD1P98161 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PKD1P98161 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PKD1P98161 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PKD1P98161 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PKD1P98161 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PKD1P98161 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PKD1P98161 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PKD1P98161 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PKD1P98161 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PKD1P98161 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PKD1P98161 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PKD1P98161 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PKD1P98161 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PKD1P98161 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PKD1P98161 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PKD1P98161 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PKD1P98161 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PKD1P98161 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PKD1P98161 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PKD1P98161 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PKD1P98161 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PKD1P98161 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PKD1P98161 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PKD1P98161 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PKD1P98161 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PKD1P98161 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PKD1P98161 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PKD1P98161 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PKD1P98161 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PKD1P98161 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PKD1P98161 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PKD1P98161 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PKD1P98161 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PKD1P98161 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PKD1P98161 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PKD1P98161 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PKD1P98161 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PKD1P98161 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
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PKD1P98161 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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PKD1P98161 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PKD1P98161 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PKD1P98161 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
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PKD1P98161 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PKD1P98161 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PKD1P98161 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PKD1P98161 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PKD1P98161 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PKD1P98161 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PKD1P98161 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PKD1P98161 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PKD1P98161 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PKD1P98161 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PKD1P98161 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PKD1P98161 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PKD1P98161 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PKD1P98161 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PKD1P98161 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PKD1P98161 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PKD1P98161 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PKD1P98161 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PKD1P98161 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PKD1P98161 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PKD1P98161 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PKD1P98161 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PKD1P98161 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PKD1P98161 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PKD1P98161 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PKD1P98161 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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