Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
VLDLRP98155 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms