Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZBED6P86452 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZBED6P86452 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZBED6P86452 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZBED6P86452 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ZBED6P86452 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZBED6P86452 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZBED6P86452 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZBED6P86452 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZBED6P86452 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZBED6P86452 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZBED6P86452 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZBED6P86452 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZBED6P86452 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZBED6P86452 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZBED6P86452 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZBED6P86452 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZBED6P86452 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZBED6P86452 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZBED6P86452 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZBED6P86452 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZBED6P86452 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZBED6P86452 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZBED6P86452 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZBED6P86452 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZBED6P86452 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZBED6P86452 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZBED6P86452 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZBED6P86452 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZBED6P86452 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZBED6P86452 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZBED6P86452 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZBED6P86452 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZBED6P86452 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZBED6P86452 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms