Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMF1P82094 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMF1P82094 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMF1P82094 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMF1P82094 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMF1P82094 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
TMF1P82094 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMF1P82094 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMF1P82094 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMF1P82094 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMF1P82094 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMF1P82094 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TMF1P82094 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TMF1P82094 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMF1P82094 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMF1P82094 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMF1P82094 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMF1P82094 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
TMF1P82094 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMF1P82094 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMF1P82094 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMF1P82094 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMF1P82094 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMF1P82094 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMF1P82094 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMF1P82094 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMF1P82094 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMF1P82094 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMF1P82094 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMF1P82094 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMF1P82094 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMF1P82094 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMF1P82094 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMF1P82094 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TMF1P82094 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMF1P82094 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TMF1P82094 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMF1P82094 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMF1P82094 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMF1P82094 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMF1P82094 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMF1P82094 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMF1P82094 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMF1P82094 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMF1P82094 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TMF1P82094 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMF1P82094 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMF1P82094 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMF1P82094 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMF1P82094 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMF1P82094 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMF1P82094 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMF1P82094 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMF1P82094 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMF1P82094 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMF1P82094 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMF1P82094 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMF1P82094 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMF1P82094 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMF1P82094 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMF1P82094 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMF1P82094 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMF1P82094 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMF1P82094 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMF1P82094 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMF1P82094 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMF1P82094 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TMF1P82094 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMF1P82094 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMF1P82094 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TMF1P82094 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMF1P82094 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TMF1P82094 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMF1P82094 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMF1P82094 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMF1P82094 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMF1P82094 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMF1P82094 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMF1P82094 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMF1P82094 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMF1P82094 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMF1P82094 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMF1P82094 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMF1P82094 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMF1P82094 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMF1P82094 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMF1P82094 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMF1P82094 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMF1P82094 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMF1P82094 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMF1P82094 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMF1P82094 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMF1P82094 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMF1P82094 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMF1P82094 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMF1P82094 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMF1P82094 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMF1P82094 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMF1P82094 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMF1P82094 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms