Protein–RNA interactions for Protein: P62745

RHOB, Rho-related GTP-binding protein RhoB, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBP62745 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOBP62745 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOBP62745 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOBP62745 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOBP62745 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOBP62745 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOBP62745 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOBP62745 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOBP62745 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOBP62745 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOBP62745 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOBP62745 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOBP62745 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOBP62745 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOBP62745 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOBP62745 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOBP62745 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOBP62745 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOBP62745 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOBP62745 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOBP62745 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOBP62745 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOBP62745 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOBP62745 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOBP62745 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOBP62745 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOBP62745 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOBP62745 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOBP62745 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOBP62745 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOBP62745 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOBP62745 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOBP62745 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOBP62745 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOBP62745 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOBP62745 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOBP62745 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOBP62745 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOBP62745 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOBP62745 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOBP62745 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOBP62745 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOBP62745 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOBP62745 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOBP62745 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOBP62745 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOBP62745 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOBP62745 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOBP62745 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOBP62745 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOBP62745 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOBP62745 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOBP62745 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOBP62745 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOBP62745 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOBP62745 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOBP62745 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOBP62745 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOBP62745 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOBP62745 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOBP62745 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOBP62745 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOBP62745 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOBP62745 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOBP62745 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOBP62745 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOBP62745 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOBP62745 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOBP62745 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOBP62745 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOBP62745 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOBP62745 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOBP62745 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOBP62745 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOBP62745 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOBP62745 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOBP62745 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOBP62745 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOBP62745 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOBP62745 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOBP62745 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOBP62745 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOBP62745 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOBP62745 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RHOBP62745 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RHOBP62745 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOBP62745 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOBP62745 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOBP62745 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOBP62745 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOBP62745 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOBP62745 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOBP62745 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOBP62745 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOBP62745 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOBP62745 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOBP62745 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOBP62745 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOBP62745 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOBP62745 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms