Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms