Protein–RNA interactions for Protein: P59045

NLRP11, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,033 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP11P59045 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP11P59045 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP11P59045 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP11P59045 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP11P59045 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP11P59045 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP11P59045 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP11P59045 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP11P59045 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP11P59045 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP11P59045 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP11P59045 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP11P59045 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP11P59045 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP11P59045 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP11P59045 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP11P59045 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP11P59045 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP11P59045 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP11P59045 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP11P59045 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP11P59045 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP11P59045 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP11P59045 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP11P59045 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP11P59045 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP11P59045 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP11P59045 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP11P59045 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP11P59045 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP11P59045 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP11P59045 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP11P59045 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP11P59045 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP11P59045 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP11P59045 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP11P59045 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP11P59045 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP11P59045 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP11P59045 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP11P59045 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP11P59045 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP11P59045 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP11P59045 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP11P59045 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP11P59045 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP11P59045 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP11P59045 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP11P59045 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP11P59045 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP11P59045 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP11P59045 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP11P59045 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP11P59045 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP11P59045 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP11P59045 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NLRP11P59045 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NLRP11P59045 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NLRP11P59045 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP11P59045 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP11P59045 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP11P59045 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP11P59045 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP11P59045 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP11P59045 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP11P59045 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP11P59045 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP11P59045 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP11P59045 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP11P59045 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP11P59045 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP11P59045 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP11P59045 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP11P59045 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP11P59045 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP11P59045 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP11P59045 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP11P59045 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP11P59045 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP11P59045 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP11P59045 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP11P59045 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP11P59045 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP11P59045 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP11P59045 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP11P59045 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP11P59045 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP11P59045 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP11P59045 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP11P59045 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP11P59045 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP11P59045 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP11P59045 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP11P59045 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP11P59045 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP11P59045 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP11P59045 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP11P59045 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP11P59045 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP11P59045 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms