Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJA9P57773 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJA9P57773 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJA9P57773 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJA9P57773 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA9P57773 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA9P57773 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA9P57773 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA9P57773 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA9P57773 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA9P57773 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA9P57773 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA9P57773 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA9P57773 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA9P57773 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA9P57773 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA9P57773 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA9P57773 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA9P57773 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA9P57773 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA9P57773 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA9P57773 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA9P57773 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA9P57773 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA9P57773 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA9P57773 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA9P57773 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA9P57773 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA9P57773 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA9P57773 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA9P57773 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA9P57773 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA9P57773 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA9P57773 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA9P57773 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA9P57773 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA9P57773 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA9P57773 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA9P57773 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA9P57773 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA9P57773 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA9P57773 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA9P57773 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA9P57773 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA9P57773 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA9P57773 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA9P57773 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA9P57773 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA9P57773 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA9P57773 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA9P57773 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA9P57773 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA9P57773 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA9P57773 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA9P57773 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA9P57773 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA9P57773 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA9P57773 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA9P57773 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA9P57773 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA9P57773 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA9P57773 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA9P57773 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA9P57773 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA9P57773 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA9P57773 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA9P57773 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA9P57773 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA9P57773 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA9P57773 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA9P57773 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA9P57773 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA9P57773 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA9P57773 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJA9P57773 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJA9P57773 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJA9P57773 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJA9P57773 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJA9P57773 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJA9P57773 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GJA9P57773 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJA9P57773 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJA9P57773 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJA9P57773 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJA9P57773 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GJA9P57773 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJA9P57773 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GJA9P57773 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJA9P57773 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJA9P57773 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJA9P57773 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GJA9P57773 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GJA9P57773 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GJA9P57773 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GJA9P57773 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
GJA9P57773 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJA9P57773 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJA9P57773 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJA9P57773 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJA9P57773 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms