Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms