Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOSBP53539 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOSBP53539 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOSBP53539 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOSBP53539 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOSBP53539 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
FOSBP53539 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOSBP53539 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
FOSBP53539 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOSBP53539 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOSBP53539 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOSBP53539 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOSBP53539 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOSBP53539 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOSBP53539 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOSBP53539 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOSBP53539 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOSBP53539 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOSBP53539 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOSBP53539 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOSBP53539 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOSBP53539 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOSBP53539 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOSBP53539 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
FOSBP53539 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOSBP53539 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
FOSBP53539 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOSBP53539 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOSBP53539 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOSBP53539 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOSBP53539 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOSBP53539 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOSBP53539 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOSBP53539 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOSBP53539 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOSBP53539 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOSBP53539 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOSBP53539 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOSBP53539 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOSBP53539 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOSBP53539 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOSBP53539 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FOSBP53539 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOSBP53539 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FOSBP53539 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOSBP53539 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOSBP53539 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOSBP53539 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOSBP53539 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOSBP53539 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOSBP53539 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FOSBP53539 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOSBP53539 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOSBP53539 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOSBP53539 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOSBP53539 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOSBP53539 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOSBP53539 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOSBP53539 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOSBP53539 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOSBP53539 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOSBP53539 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOSBP53539 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOSBP53539 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOSBP53539 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOSBP53539 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
FOSBP53539 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOSBP53539 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOSBP53539 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOSBP53539 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOSBP53539 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOSBP53539 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOSBP53539 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOSBP53539 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOSBP53539 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOSBP53539 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOSBP53539 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOSBP53539 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOSBP53539 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOSBP53539 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOSBP53539 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOSBP53539 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOSBP53539 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOSBP53539 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FOSBP53539 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOSBP53539 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOSBP53539 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOSBP53539 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOSBP53539 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOSBP53539 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOSBP53539 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOSBP53539 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOSBP53539 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOSBP53539 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOSBP53539 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOSBP53539 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOSBP53539 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOSBP53539 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOSBP53539 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOSBP53539 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms