Protein–RNA interactions for Protein: P51159

RAB27A, Ras-related protein Rab-27A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB27AP51159 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms