Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC4A3P48751 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC4A3P48751 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC4A3P48751 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC4A3P48751 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC4A3P48751 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC4A3P48751 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC4A3P48751 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC4A3P48751 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC4A3P48751 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC4A3P48751 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC4A3P48751 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC4A3P48751 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC4A3P48751 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC4A3P48751 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC4A3P48751 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC4A3P48751 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC4A3P48751 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A3P48751 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A3P48751 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A3P48751 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A3P48751 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A3P48751 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A3P48751 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A3P48751 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A3P48751 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A3P48751 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A3P48751 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A3P48751 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A3P48751 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A3P48751 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A3P48751 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms