Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GCLMP48507 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GCLMP48507 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCLMP48507 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCLMP48507 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCLMP48507 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCLMP48507 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCLMP48507 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCLMP48507 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCLMP48507 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCLMP48507 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCLMP48507 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCLMP48507 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCLMP48507 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCLMP48507 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCLMP48507 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCLMP48507 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCLMP48507 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCLMP48507 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCLMP48507 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCLMP48507 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCLMP48507 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCLMP48507 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GCLMP48507 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCLMP48507 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCLMP48507 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCLMP48507 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCLMP48507 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCLMP48507 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCLMP48507 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCLMP48507 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCLMP48507 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCLMP48507 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GCLMP48507 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCLMP48507 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCLMP48507 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GCLMP48507 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCLMP48507 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCLMP48507 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCLMP48507 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCLMP48507 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCLMP48507 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCLMP48507 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCLMP48507 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCLMP48507 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCLMP48507 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCLMP48507 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GCLMP48507 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCLMP48507 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCLMP48507 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCLMP48507 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCLMP48507 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCLMP48507 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCLMP48507 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCLMP48507 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCLMP48507 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCLMP48507 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCLMP48507 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCLMP48507 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCLMP48507 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GCLMP48507 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCLMP48507 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCLMP48507 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCLMP48507 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCLMP48507 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GCLMP48507 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GCLMP48507 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GCLMP48507 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GCLMP48507 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCLMP48507 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GCLMP48507 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GCLMP48507 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GCLMP48507 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GCLMP48507 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GCLMP48507 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GCLMP48507 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GCLMP48507 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GCLMP48507 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCLMP48507 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GCLMP48507 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCLMP48507 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GCLMP48507 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCLMP48507 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCLMP48507 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCLMP48507 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCLMP48507 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCLMP48507 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCLMP48507 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCLMP48507 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCLMP48507 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCLMP48507 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCLMP48507 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GCLMP48507 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCLMP48507 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCLMP48507 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCLMP48507 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCLMP48507 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GCLMP48507 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCLMP48507 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCLMP48507 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms