Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms