Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms